O Departamento de Fisioterapia, Fonoaudiologia e Terapia Ocupacional da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP) foi criado em 1999, desenvolvendo atividades de ensino, pesquisa e extensão.
O departamento abriga três cursos de graduação que existem há quase 50 anos na FMUSP: Fisioterapia, Fonoaudiologia e Terapia Ocupacional.
Em 2001, o Departamento iniciou o processo de criação de um Programa de Pós Graduação, já que muitos docentes, desde 1997, orientavam em programas de Pós Graduação na FMUSP e outras unidades da USP.
Em 12 de dezembro de 2004 foi criado o Programa Ciências da Reabilitação, que no final de 2022, conquistou o conceito 6 na avaliação CAPES.
O programa abrange quatro linhas de pesquisa:
Audição
Linguagem
Função e Disfunção em Fisioterapia
Intervenção Social em Terapia Ocupacional